Allen in Deutschland und der EU abgesetzten Biokraftstoffen ist gemein, dass sie seit 2011 hohe Anforderungen in Bezug auf ihre nachhaltige Erzeugung erfüllen müssen. Über die europäische Erneuerbare-Energie-Richtlinie (RED II und III) sowie die nationale Nachhaltigkeitsverordnung (BioKraft-NachV) sind Kriterien definiert, die sicherstellen sollen, dass beim Biomasseanbau weltweit keine Lebensräume mit hoher Biodiversität verloren gehen. 

Biokraftstoffe müssen gegenüber fossilen Kraftstoffen mindestens 60 % Treibhausgase einsparen. Zudem müssen sie als nachhaltig zertifiziert sein.

Die Einsparung der Treibhausgasemissionen umfasst die gesamte Wertschöpfungskette. Manche Biokraftstoffe zeichnen sich schon heute durch über 90 % Treibhausgasminderung aus. 

Treibhausgasreduzierung und Zertifizierung sind für Biokraftstoffe gesetzlich vorgeschrieben. Zertifizierung und Dateneintrag in das System NABISY werden von der Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung überwacht.